Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP35Q9P2H5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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