Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNK4Q9NYG8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNK4Q9NYG8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms