Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PNPLA8Q9NP80 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PNPLA8Q9NP80 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms