Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms