Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms