Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPRIN2Q6IMN6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms