Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf135Q5VTT2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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