Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AGAP9Q5VTM2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AGAP9Q5VTM2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms