Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms