Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC142Q17RM4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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