Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HIF1AQ16665 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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