Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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VAMP3Q15836 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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VAMP3Q15836 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 COL8A1-201ENST00000261037 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
VAMP3Q15836 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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