Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NPTX1Q15818 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms