Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RSU1Q15404 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms