Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
FHL3Q13643 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FHL3Q13643 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms