Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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KCNMA1Q12791 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCNMA1Q12791 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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