Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYP4F3Q08477 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYP4F3Q08477 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms