Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALD1Q05682 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CALD1Q05682 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms