Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREMQ03060 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREMQ03060 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREMQ03060 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREMQ03060 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREMQ03060 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CREMQ03060 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CREMQ03060 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREMQ03060 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms