Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms