Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2P78314 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms