Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-24P63145 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms