Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
HERVK_113P63121 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms