Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms