Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMPOP42166 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMPOP42166 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms