Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA7P31268 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms