Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CD40LGP29965 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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