Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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CXCL3P19876 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CXCL3P19876 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CXCL3P19876 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CXCL3P19876 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CXCL3P19876 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CXCL3P19876 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CXCL3P19876 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL3P19876 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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