Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CLDN9O95484 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CLDN9O95484 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CLDN9O95484 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN9O95484 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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