Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SEC22BO75396 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEC22BO75396 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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