Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIN3BO75182 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms