Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms