Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN8O00124 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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UBXN8O00124 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN8O00124 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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