Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NPIPB9F8W1W9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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NPIPB9F8W1W9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPIPB9F8W1W9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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