Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ABCF2Q9UG63 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABCF2Q9UG63 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms