Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF7Q9UBF6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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