Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms