Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KLHL28Q9NXS3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms