Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF6Q9BYE7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms