Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRTQ9BXP5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms