Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms