Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HIGD2AQ9BW72 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 339.7 ms