Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRIG3Q6UXM1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms