Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMPD1Q5SYB0 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMPD1Q5SYB0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms