Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms