Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CDO1Q16878 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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CDO1Q16878 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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