Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DDR2Q16832 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DDR2Q16832 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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