Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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