Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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