Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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